AT1G19390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.995 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Wall-associated kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Wall-associated kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system, integral to membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Wall-associated kinase (InterPro:IPR013695), EGF-like calcium-binding, conserved site (InterPro:IPR018097), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: wall-associated kinase, putative (TAIR:AT4G31100.1); Has 120805 Blast hits to 118813 proteins in 4422 species: Archae - 117; Bacteria - 13519; Metazoa - 45006; Fungi - 10268; Plants - 33776; Viruses - 486; Other Eukaryotes - 17633 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6700772..6703368 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 87396.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 788 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRCDNNYSFS ILFSLLLILI LDSKVVSLST SCQSKSVCGN INIPYPFGIE KGCYLNEWYK IECKNATYPF LFKMGMAVVN ISLPGDDGYN NPVSYGSIRV 101: KIPITSIGCS RDGKESGSVL NFTDSPFYFG IGNSLVAVGC NSKASLTNIN PSKVGCELNC TASKETLPSK SIPFFDKTGC SNNKLPYYSS LCTKNNGEDE 201: RSCDGNGCCI AGLLDSEAPQ VIGINIESFD HGNSTKLECR VAFLTDDVSP FSNASEPKRL FAKRYATVSL GWVIQTKNLS FVNSLSCKNT KEYDNSTYNI 301: KLVTSCICNN VTISGTDYAN CGCSQGYEGN PYLPGGCKDI NECLRNSYGQ RQNCRESDTC VNLPGTFNCI GNKTRVTMIG VGSAFGILVL VVGIWWLRKF 401: LKKRRMSKRK RKFFKRNGGL LLQQQLNTNK GNVEKTRIFS SRELEKATDN FSESRILGQG GQGTVYKGML VDGRTVAVKK SKVVDEDKLE EFINEVVILS 501: QINHRHVVKL LGCCLETEVP TLVYEFIPNG NLFQHIHEES DDYTKTWGMR LRIAVDIAGA LSYLHSAASS PIYHRDIKST NILLDEKYRT KVSDFGTSRS 601: VTIDHTHWTT VISGTVGYVD PEYYGSSQYT DKSDVYSFGV VLVELITGEK PVITVSNSQE IRGLADHFRV AMKENRFFEI MDARIRDGCK PEQVMAVANL 701: ARRCLNSKGK KRPCMRKVFT DLEKILASQE DSLVNIENDD GADDEEEGMT MINIDDSQTI YVTAPAPSIV ASSSSSDVQP LFPHPTWI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)