AT1G18790.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RWP-RK domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
RWP-RK domain-containing protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plant regulator RWP-RK (InterPro:IPR003035); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RWP-RK domain-containing protein (TAIR:AT1G74480.1); Has 558 Blast hits to 554 proteins in 54 species: Archae - 0; Bacteria - 12; Metazoa - 59; Fungi - 0; Plants - 419; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 68 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6478851..6480043 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30639.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 269 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKSFCKLEYD QVFGKENNSF SFLNHSSLYS HQSELANPFF ELEDEMLPSA TSSNCFTSAS SFLALPDLEP ISIVSHEADI LSVYGSASWT AEETMFVSDF 101: AKKSETTTTK KRRCREECFS SCSVSKTLSK ETISLYFYMP ITQAARELNI GLTLLKKRCR ELGIKRWPHR KLMSLQKLIS NVKELEKMEG EENEDKLRNA 201: LEKLEKEKKT IEKLPDLKFE DKTKRLRQAC FKANHKRKRR SGMSTPITSS SSSASASSSS YSSVSGFER |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)