AT1G18170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein; FUNCTIONS IN: FK506 binding, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity; INVOLVED IN: protein folding; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type (InterPro:IPR001179); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein (TAIR:AT1G73655.1); Has 2743 Blast hits to 2728 proteins in 885 species: Archae - 0; Bacteria - 1518; Metazoa - 283; Fungi - 83; Plants - 455; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 404 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6254291..6255507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26530.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 247 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANLFTATAP FLSLSKPFTK TASYHQCYAS SSNPPEPESS SPPPPPPPPQ PLASQQKRKK NVETTDWVAS SLTRRFGIGA GLAWAGFLAF GVISEQIKTR 101: IEVSQEVANT RDVEEEKEIV LPNGIRYYDQ RVGGGATPRA GDLVVIDLKG QVQGTGQVFV DTFGTKDKKK MKPLALVVGS KPYSKGLCEG IDYVLRSMKA 201: GGKRRVIVPP SLGFGVDGAE LESGLQIPPN ASLEYIVEID RVSIAPA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)