AT1G18020.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.942 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FMN-linked oxidoreductases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
FMN-linked oxidoreductases superfamily protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, FMN binding, catalytic activity; INVOLVED IN: metabolic process; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase, N-terminal (InterPro:IPR001155), Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FMN-linked oxidoreductases superfamily protein (TAIR:AT1G17990.1); Has 13076 Blast hits to 13058 proteins in 2049 species: Archae - 127; Bacteria - 9786; Metazoa - 29; Fungi - 859; Plants - 433; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1842 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6202272..6203572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29974.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 269 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: METKQSIPLL MPYKMGPFNL SHRVVLAPLT RSRSYGNIPQ PNAKLYYTQR TTPGGLLISE SCVVSETSLG YPDLPGLWNR DQVEAWKPIV DAVHSKGGIF 101: FCQIWHGGRV FHQDQPNGEA PVSSTDKPLM CKNMYGGQFK PPRRLRSDEL PAIVNDFRIA ARNAIEAGFD GVEVHGAHGY LIDQFLKDKV NDRSDQYGGS 201: LENRCRFALE VIEAVVNEIG SDRVGIRLSP FADYMESGDS NPEALGLYLV QAMNKHGMES STVTWLNLE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)