AT1G16120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.908 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : wall associated kinase-like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
wall-associated kinase like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
wall associated kinase-like 1 (WAKL1); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system, integral to membrane, cell wall; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Wall-associated kinase (InterPro:IPR013695), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: wall associated kinase-like 5 (TAIR:AT1G16160.1); Has 123437 Blast hits to 121647 proteins in 4379 species: Archae - 141; Bacteria - 14104; Metazoa - 45195; Fungi - 10752; Plants - 34405; Viruses - 501; Other Eukaryotes - 18339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5522639..5524983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 81215.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 730 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKTKTSIFQF IVASVLTLLI NDSSAATPPP PISNSSTSCN KTCGGISIPF PFGIGGKDCY LNGWYEVICN TTTSDSNTTV PLLSMINREV VNISLPDSNE 101: PYGLVQIKGP VTSLGCSSNT SEGPQNSLPV LNVTGKGSPY FLTDENRLVA VGCGIKALMT DTESEILGCE SSCEHRKSGE EVTNLICTGY RCCQARLPVG 201: RPQAITVNIE NSSGGEETCK VAFLTDKRYS PSNVTEPEQF HNNGYVVLEL GWYFATSNSR FKSLLGCTNM SRKGSGFSDD NCSCEYDYFS GMSYRNCYCD 301: YGYTGNPYLR GGCVDTDSCE GNHNCGEDAH CVNMPGPMSM CRPNPKITKP TKPPVLQGIL IGLSGLVFFV GLFWLFKLIK KRRNINRSKK FFKRNGGLLL 401: KQQLTTKDGN VEMSKIFSSK ELRKATDNFS IDRVLGQGGQ GTVYKGMLVD GSIVAVKRSK VVDEDKMEEF INEIVLLSQI NHRNIVKLLG CCLETEVPIL 501: VYEYIPNGDL FKRLHDESDD YTMTWEVRLR IAIEIAGALT YMHSAASFPI FHRDIKTTNI LLDEKYRAKV SDFGTSRSVT LDQTHLTTLV AGTFGYMDPE 601: YFLSSQYTHK SDVYSFGVVL VELITGEKPL SRVRSEEGRG LATHFLEAMK ENRVIDIIDI RIKDESKLEQ VMAVAKLARK CLNRKGKNRP NMKEVSNELE 701: RIRSSPEDLD VRTENEDEEE DQPMAINNKR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)