AT1G15880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : golgi snare 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Golgi SNARE 11 protein (GOS11) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
golgi snare 11 (GOS11); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: golgi snare 12 (TAIR:AT2G45200.1); Has 412 Blast hits to 412 proteins in 171 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 161; Fungi - 123; Plants - 99; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 29 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:5458718..5460089 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25215.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 223 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDVPSSWDAL RKQARKIEAQ LDEQMHSYRR LVSTKALSKS DGNESDLEAG IDLLLRQLQQ VNAQMQAWVS SGGSEMVSHT LTRHQEILQD LTQEFYRHRS 101: SLRAKQEHAS LLEDFREFDR TRLDLEDGYG SEQALIKEHM GINRNTAQMD GVISQAQATL GTLVFQRSTF GGINSKLSNV ASRLPTVNTI LAAIKRKKSM 201: DTIILSLVAA VCTFLIFIYW ITK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)