AT1G15500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : TLC ATP/ADP transporter | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATNTT2; FUNCTIONS IN: ATP:ADP antiporter activity; INVOLVED IN: transport; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope, cytoplasm; EXPRESSED IN: 7 plant structures; EXPRESSED DURING: M germinated pollen stage, seedling growth; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ADP/ATP carrier protein (InterPro:IPR004667); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleotide transporter 1 (TAIR:AT1G80300.1); Has 767 Blast hits to 762 proteins in 173 species: Archae - 0; Bacteria - 466; Metazoa - 8; Fungi - 28; Plants - 101; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 164 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5326426..5328688 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67533.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 618 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGLIQTRGI LSLPAKPIGV RRLLQPSHGL KQRLFTTNLP ALSLSSNGHK KFQAFQQIPL GISVSHKERS RGFICKAEAA AAGGGNVFDE GDTAAMAVSP 101: KIFGVEVTTL KKIVPLGLMF FCILFNYTIL RDTKDVLVVT AKGSSAEIIP FLKTWVNLPM AIGFMLLYTK LSNVLSKKAL FYTVIVPFIV YFGAFGFVMY 201: PLSNLIHPEA LADKLLATLG PRFMGPLAIM RIWSFCLFYV MAELWGSVVV SVLFWGFANQ ITTVDEAKKF YPLFGLGANV ALIFSGRTVK YFSNMRKNLG 301: PGVDGWAVSL KAMMSIVVGM GLAICFLYWW VNRYVPLPTR SKKKKVKPQM GTMESLKFLV SSPYIRDLAT LVVAYGISIN LVEVTWKSKL KAQFPSPNEY 401: SAFMGDFSTC TGIATFTMML LSQYVFKKYG WGVAAKITPT VLLLTGVAFF SLILFGGPFA PLVAKLGMTP LLAAVYVGAL QNIFSKSAKY SLFDPCKEMA 501: YIPLDEDTKV KGKAAIDVVC NPLGKSGGAL IQQFMILTFG SLANSTPYLG VILLGIVTAW LAAAKSLEGQ FNTLMSEEEL EREMERASSV KIPVVSQEDA 601: PSGETTSQLS EKSTPTGI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)