AT1G15190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Fasciclin-like arabinogalactan family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Fasciclin-like arabinogalactan family protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: flower; EXPRESSED DURING: petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAS1 domain (InterPro:IPR000782); Has 106 Blast hits to 85 proteins in 8 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 106; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5227275..5228021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26737.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 248 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKISSASCF RAIFLGALII LCLPHPSTGV PLEELERAIA ILRVRGRALF ANAIITSDLL FDLLSDESLT LFAPTDSMLF DLDMTHSLPF YVSTLRLHSV 101: PLRLSLSGLR SLPNSSSLPT LLPSHRLLLT KHSSSNDSIF LDGVQLLIPG LFDGQHIAVH GLADLLPLTA PSSPNRLVED STALAKSPWF LGSRFSPAPE 201: PYFAFMDLSP AESPSVEEVS PSPSWGEGEE DFIVGDEGGP LDGRNNGF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)