AT1G14686.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ENTH/ANTH/VHS superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ENTH/ANTH/VHS superfamily protein; FUNCTIONS IN: phospholipid binding, clathrin binding, binding, phosphatidylinositol binding; INVOLVED IN: clathrin coat assembly; LOCATED IN: clathrin coat; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Epsin-like, N-terminal (InterPro:IPR013809), Clathrin adaptor, phosphoinositide-binding, GAT-like (InterPro:IPR014712), ANTH (InterPro:IPR011417), ENTH/VHS (InterPro:IPR008942); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ENTH/VHS/GAT family protein (TAIR:AT2G01920.1); Has 354 Blast hits to 311 proteins in 17 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 2; Plants - 352; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:5045781..5046800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38090.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 339 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLWKRAAVV LKDGPSLIAA DDILTAAVVK ATSHDELSID TESAQFIYRH VLSSPSSLKP LVSLISSRVK RTRSWAVALK GLMLMHGFFL CKSTVAESIG 101: RLPFDLSSFG EGNSRIMSKS GGFNLFVRAY FAFLDRRSIL FHDGNRHRYN EESSVLIRLV IIRKMQIIVD SLIRIKPIGE NMMIPVINEA MENVVSEIME 201: IYGWICRRIA EVLPNVHSKI GKTEADLALK IVAKSMKQGG ELKKYFEFCK DLGVSNAQEI PNFVRIPEAD VIHLDELVRT AMESSEESAE RTEIAEEEEE 301: EEEEIETKLS DLITLDHNEE APASPPRVVV VDIPDLISF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)