AT1G14520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : myo-inositol oxygenase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes MIOX1. Belongs to myo-inositol oxygenase gene family. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
myo-inositol oxygenase 1 (MIOX1); FUNCTIONS IN: inositol oxygenase activity, oxidoreductase activity; INVOLVED IN: syncytium formation; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 6 plant structures; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF706 (InterPro:IPR007828); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: myo-inositol oxygenase 2 (TAIR:AT2G19800.1); Has 490 Blast hits to 488 proteins in 159 species: Archae - 0; Bacteria - 27; Metazoa - 132; Fungi - 132; Plants - 97; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 102 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:4968376..4969954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36575.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 311 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTILIDRHSD QNDAGDEIVE KNQGNGKEEE TELVLDAGFE APHTNSFGRT FRDYDAESER RRGVEEFYRV NHIGQTVDFV RKMREEYEKL NRTEMSIWEC 101: CELLNEFIDE SDPDLDEPQI EHLLQTAEAI RKDYPDEDWL HLTGLIHDLG KVLLHSSFGE LPQWAVVGDT FPVGCAFDES IVHHKYFKEN PDYDNPSYNS 201: KYGIYTEGCG LDNVLMSWGH DDYMYLVAKE NQTTLPSAGL FIIRYHSFYA LHKSEAYKHL MNNEDRENMK WLKVFNKYDL YSKSKVRVNV EEVKPYYLSL 301: TNKYFPSKLK W |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)