AT1G14070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.816 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fucosyltransferase 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Xyloglucan fucosyltransferase family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fucosyltransferase 7 (FUT7); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups, fucosyltransferase activity; INVOLVED IN: cell wall biogenesis; LOCATED IN: endomembrane system, membrane; EXPRESSED IN: stem, cauline leaf, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Xyloglucan fucosyltransferase (InterPro:IPR004938); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fucosyltransferase 6 (TAIR:AT1G14080.1); Has 333 Blast hits to 324 proteins in 18 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 330; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:4818548..4820150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58530.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 509 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLLLLSFSNI FKHQLLGATI NVGSKDSVKP RDRLLGGLLT ADFDEDSCLS RYQSSLYRKP SPYRTSEYLI SKLRNYEMLH KRCGPGTDAY KRATEKLGHD 101: HENVGDSSDG ECKYIVWVAV YGLGNRILTL ASVFLYALLT ERIILVDQRK DISDLFCEPF PGTSWLLPLD FPLMGQIDSF NREYSHCYGT MLKNHTINST 201: TIPSHLYLHL LHDYRDQDKM FFCQKDQSLV DKVPWLVVKS NLYFIPSLWL NPSFQTELIK LFPQKDTVFY HLARYLFHPT NQVWGMVTRS YNAYLSRADE 301: ILGIQVRVFS RQTKYFQHVM DQIVACTQRE KLLPEFAAQE EAQVTNTSNP SKLKAVLVTS LNPEYSNNLK KMYWEHPTTT GDIVEVYQPS RERFQQTDKK 401: LHDQKALAEM YLLSLTDKLV TSALSTFGYV AQGLGGLKPW ILYTPKKFKS PNPPCGRVIS MEPCFLTPPV HGCEAKKGIN TAKIVPFVRH CEDLRHYGLK 501: LVDDTKNEL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)