AT1G12960.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L18e/L15 (InterPro:IPR021131); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein (TAIR:AT1G70600.1); Has 791 Blast hits to 789 proteins in 315 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 342; Fungi - 162; Plants - 138; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 149 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:4422707..4423155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 11814.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 104 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTTSRKKTRN LREHVSVGHG RFGKHRKLPG SRGNAGVGMR YFHKLRNKFY CQIVNLDKLW SMVLGKGFLP ENKPVVVKAK LVSNTDEKKI KEAGSAVVLT 101: FLLY |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)