AT1G12650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF947 (InterPro:IPR009292); Has 700 Blast hits to 631 proteins in 192 species: Archae - 0; Bacteria - 32; Metazoa - 138; Fungi - 168; Plants - 60; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 302 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:4306183..4307673 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29100.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 248 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKGAGKFEGS SSKIVFEDSE EDEDLSCSSV SSSDEEEETE KELTFEEIHK LRADGSKAVP WKPNQVKKTG RARANKNRPM EVSSKKPVSR YREVVHVPKK 101: EVRDPRFNQL GGTLDVEGFR KRYNFFFEDK LPVEREELKK KLKKTKNPEE IDELKNQLTY VEKMLKYEPS TQNKGAAILT EHKKKEREAA KEGKRPYYLK 201: KSEIRKQTLI EKYNSLKESG KLTSYLDKRR KKNATKDHRF MPYRRAEE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)