AT1G12010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.859 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein that appears to have 1-amino-cyclopropane-1-carboxylic acid oxidase activity based on mutant analyses. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase (InterPro:IPR005123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ACC oxidase 2 (TAIR:AT1G62380.1); Has 8592 Blast hits to 8546 proteins in 1001 species: Archae - 0; Bacteria - 1125; Metazoa - 104; Fungi - 1034; Plants - 4961; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1368 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:4056274..4057670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36533.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 320 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEMNIKFPVI DLSKLNGEER DQTMALIDDA CQNWGFFELV NHGLPYDLMD NIERMTKEHY KKHMEQKFKE MLRSKGLDTL ETEVEDVDWE STFYLHHLPQ 101: SNLYDIPDMS NEYRLAMKDF GKRLEILAEE LLDLLCENLG LEKGYLKKVF HGTTGPTFAT KLSNYPPCPK PEMIKGLRAH TDAGGLILLF QDDKVSGLQL 201: LKDGDWVDVP PLKHSIVINL GDQLEVITNG KYKSVMHRVM TQKEGNRMSI ASFYNPGSDA EISPATSLVD KDSKYPSFVF DDYMKLYAGL KFQAKEPRFE 301: AMKNAEAAAD LNPVAVVETF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)