AT1G11840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glyoxalase I homolog | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a glyoxalase I homolog ATGLX1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glyoxalase I homolog (GLX1); FUNCTIONS IN: lactoylglutathione lyase activity, metal ion binding; INVOLVED IN: response to cadmium ion, carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: peroxisome, plasma membrane, vacuole, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glyoxalase I (InterPro:IPR004361), Glyoxalase I, conserved site (InterPro:IPR018146), Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase (InterPro:IPR004360); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily protein (TAIR:AT1G67280.1); Has 8678 Blast hits to 5178 proteins in 1682 species: Archae - 141; Bacteria - 5669; Metazoa - 503; Fungi - 263; Plants - 249; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1853 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3996045..3997518 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31930.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 283 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEASDLLEW PKKDNRRFLH VVYRVGDLDR TIEFYTEVFG MKLLRKRDIP EEKYSNAFLG FGPETSNFVV ELTYNYGVSS YDIGTGFGHF AISTQDVSKL 101: VENVRAKGGN VTREPGPVKG GGSVIAFVKD PDGYTFELIQ RGPTPEPFCQ VMLRVGDLDR AIKFYEKALG MRLLRKIERP EYKYTIGMMG YAEEYESIVL 201: ELTYNYDVTE YTKGNAYAQI AIGTDDVYKS GEVIKIVNQE LGGKITREAG PLPGLGTKIV SFLDPDGWKT VLVDNKDFLK ELE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)