AT1G11610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
putative cytochrome P450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 18 (CYP71A18); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 13 (TAIR:AT2G30770.1); Has 34927 Blast hits to 34697 proteins in 1764 species: Archae - 51; Bacteria - 4686; Metazoa - 11898; Fungi - 7343; Plants - 9704; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1242 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:3907461..3909291 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56279.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 497 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEMTLMVSLC LTTLLTLLLL KKFLKRTAKK VNLPPSPWRI PVIGNLHQLS LHPHRSLHSL SLRYGPLMLL HFGRVPILVV SSSEAAHEIL KTHDLKFANR 101: PKSKAVHGLM NGGRDVVFGP YGEYWRQMKS VCILNLLTNK MVASFEKVRE EEVNAMMEKL EKASCSSSAE NLSELFVTLT SDVTSRVSLG KKYWEDETAG 201: GLKKRVRQIM ELLREFPIGD YVPALAWIDR INGFNSKIVE VSRAYSDLME KVVQEHLEAG EHKADFVNIL LSIEKEKNNG FKVQRNDIKF MILDMFIGGI 301: STSSTLLEWI MTELIRNPEC MKKLQNEIRS TIRPHGSYIK EKEVENMRYL KAVIKEVFRV HPPLPLILPR LLTEDVKVKG YDIAAGTEVL INAWSIHRDP 401: AIWGPDAEEF KPERHLDSTL DYHGQDLKYI PFGSGRRICP GINLAMGLVE VTLANLVGRF DWSVDPGPNG DQPDLAEDFG LDVCRKNPLI AFPSSVA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)