AT1G11330.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-locus lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), Apple-like (InterPro:IPR003609), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-domain-1 13 (TAIR:AT1G11350.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3810372..3813416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 94323.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 842 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVVSVTIRRR FVLLLLACTC LLSRRLCFGE DRITFSSPIK DSESETLLCK SGIFRFGFFT PVNSTTRLRY VGIWYEKIPI QTVVWVANKD SPINDTSGVI 101: SIYQDGNLAV TDGRNRLVWS TNVSVPVAPN ATWVQLMDSG NLMLQDNRNN GEILWESFKH PYDSFMPRMT LGTDGRTGGN LKLTSWTSHD DPSTGNYTAG 201: IAPFTFPELL IWKNNVPTWR SGPWNGQVFI GLPNMDSLLF LDGFNLNSDN QGTISMSYAN DSFMYHFNLD PEGIIYQKDW STSMRTWRIG VKFPYTDCDA 301: YGRCGRFGSC HAGENPPCKC VKGFVPKNNT EWNGGNWSNG CMRKAPLQCE RQRNVSNGGG GGKADGFLKL QKMKVPISAE RSEASEQVCP KVCLDNCSCT 401: AYAYDRGIGC MLWSGDLVDM QSFLGSGIDL FIRVAHSELK THSNLAVMIA APVIGVMLIA AVCVLLACRK YKKRPAPAKD RSAELMFKRM EALTSDNESA 501: SNQIKLKELP LFEFQVLATS TDSFSLRNKL GQGGFGPVYK GKLPEGQEIA VKRLSRKSGQ GLEELMNEVV VISKLQHRNL VKLLGCCIEG EERMLVYEYM 601: PKKSLDAYLF DPMKQKILDW KTRFNIMEGI CRGLLYLHRD SRLKIIHRDL KASNILLDEN LNPKISDFGL ARIFRANEDE ANTRRVVGTY GYMSPEYAME 701: GFFSEKSDVF SLGVIFLEII SGRRNSSSHK EENNLNLLAY AWKLWNDGEA ASLADPAVFD KCFEKEIEKC VHIGLLCVQE VANDRPNVSN VIWMLTTENM 801: SLADPKQPAF IVRRGASEAE SSDQSSQKVS INDVSLTAVT GR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)