AT1G10810.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.710 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, aldo-keto reductase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldo/keto reductase (InterPro:IPR001395); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein (TAIR:AT1G60730.1); Has 29108 Blast hits to 29087 proteins in 2572 species: Archae - 640; Bacteria - 19713; Metazoa - 1440; Fungi - 2153; Plants - 1216; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3946 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3599369..3600757 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37598.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 344 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAASGVRRI KLGSQGLEVS AQGLGCMGLS IFDGTTKVET DLIALIHHAI NSGITLLDTS DIYGPETNEL LLGQALKDGM REKVELATKF GLLLKDQKLG 101: YRGDPAYVRA ACEASLRRLG VSCIDLYYQH RIDTTVPIEV TIGELKKLVE EGKIKYIGLS EACASTIRRA HAVHPLTAVQ LEWSLWSRDV EEDIIPTCRE 201: LGIGIVAYSP LGLGFFAAGP KFIESMDNGD YRKGLPRFQQ ENLDHNKILY EKVNAMAEKK SCTPAQLALA WVHHQGNDVC PIPGTSKIKN LNQNIGALSV 301: KLSIEEMAEL DAMGHPDSVK GERSATYIVT YKNSETPPLS SWTS |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)