AT1G10670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP-citrate lyase A-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
One of the three genes encoding subunit A of the trimeric protein ATP Citrate Lyase. Antisense ACLA-1 plants cause a reduction in cytosolic acetyl-CoA metabolism and have upregulation of stress-related genes and down-regulation of primary metabolism and growth genes, suggesting the mutation restricts normal growth and developmental processes and puts the plant into a state of stress. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATP-citrate lyase A-1 (ACLA-1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATP-grasp fold, subdomain 2 (InterPro:IPR013816), ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type (InterPro:IPR013650), Succinyl-CoA synthetase-like (InterPro:IPR016102); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP-citrate lyase A-2 (TAIR:AT1G60810.1); Has 5465 Blast hits to 5464 proteins in 1555 species: Archae - 120; Bacteria - 3046; Metazoa - 362; Fungi - 200; Plants - 107; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1630 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3535787..3538098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46681.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 423 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARKKIREYD SKRLVKEHFK RLSGKELPIR SVQINETTDL NELVEKEPWL SSEKLVVKPD MLFGKRGKSG LVALKLDFAD VATFVKERLG KEVEMSGCKG 101: PITTFIVEPF VPHNEEYYLN VVSDRLGCSI SFSECGGIEI EENWDKVKTI FLPTGASLTP EICAPLVATL PLEIKAEIEE FIKVIFTLFQ DLDFTFLEMN 201: PFTLVDGSPY PLDMRGELDD TAAFKNFKKW GDIEFPLPFG RVMSPTESFI HGLDEKTSAS LKFTVLNPKG RIWTMVAGGG ASVIYADTVG DLGYASELGN 301: YAEYSGAPKE DEVLQYARVV IDCATANPDG KSRALVIGGG IANFTDVAAT FNGIIRALKE KEAKLKAARM HIFVRRGGPN YQKGLAKMRA LGDDIGVPIE 401: VYGPEATMTG ICKEAIQYIT AAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)