AT1G10060.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.994 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : branched-chain amino acid transaminase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a mitochondrial branched-chain amino acid aminotransferase. Complements the yeast leu/iso-leu/val auxotrophy mutant. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
branched-chain amino acid transaminase 1 (BCAT-1); FUNCTIONS IN: branched-chain-amino-acid transaminase activity, protein binding, catalytic activity; INVOLVED IN: branched chain family amino acid metabolic process, metabolic process; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 15 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aminotransferase, class IV (InterPro:IPR001544), Aminotransferase, class IV, conserved site (InterPro:IPR018300), Branched-chain amino acid aminotransferase II (InterPro:IPR005786); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: branched-chain amino acid transaminase 2 (TAIR:AT1G10070.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3285233..3286837 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34422.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 318 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFATKSCRDG NFEQGYLSRY GNIELNPAAG ILNYGQGLIE GMKAYRGEDG RVLLFRPELN AMRMKIGAER MCMHSPSVHQ FIEGVKQTVL ANRRWVPPPG 101: KGSLYLRPLL FGSGASLGVA AASEYTFLVF GSPVQNYFKE GTAALNLYVE EVIPRAYLGG TGGVKAISNY GPVLEVMRRA KSRGFSDVLY LDADTGKNIE 201: EVSAANIFLV KGNTIVTPAT SGTILGGITR KSIIEIALDL GYKVEERSVP VEELKEAEEV FCTGTAAGVA SVGSITFKNT RTEYKVGDGI VTQQLRSILV 301: GIQTGSIQDT KDWVLQIA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)