AT1G09830.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glycinamide ribonucleotide (GAR) synthetase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
glycinamide ribonucleotide synthetase (GAR synthetase) that catalyzes the conversion of phosphoribosyl amine to phosphoribosyl glycineamide | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Glycinamide ribonucleotide (GAR) synthetase; FUNCTIONS IN: phosphoribosylamine-glycine ligase activity; INVOLVED IN: purine base biosynthetic process, purine nucleotide biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphoribosylglycinamide synthetase, conserved site (InterPro:IPR020559), Phosphoribosylglycinamide synthetase, C-domain (InterPro:IPR020560), Phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp (A) domain (InterPro:IPR020561), ATP-grasp fold, subdomain 1 (InterPro:IPR013815), PreATP-grasp-like fold (InterPro:IPR016185), Phosphoribosylglycinamide synthetase, N-domain (InterPro:IPR020562), ATP-grasp fold (InterPro:IPR011761), ATP-grasp fold, subdomain 2 (InterPro:IPR013816), Pre-ATP-grasp fold (InterPro:IPR013817), Rudiment single hybrid motif (InterPro:IPR011054), Phosphoribosylglycinamide synthetase (InterPro:IPR000115); Has 12648 Blast hits to 12644 proteins in 2666 species: Archae - 340; Bacteria - 7373; Metazoa - 216; Fungi - 226; Plants - 88; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4405 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:3192783..3194936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56476.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 532 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSLCASNCY PSSSSINLFS NNNNPTKPFL LSLRFASSNS LPFVAPLKFS TTNHVLSNSR FSSNRIQRRL FLLRCVSEES QPSLSIGNGG SEERVNVLVI 101: GGGGREHALC HALKRSPSCD SVLCAPGNAG ISSSGDATCV PDLDISDSLA VISFCQKWNV GLVVVGPEVP LVAGLANDLV KAGILTFGPS SQAAALEGSK 201: NFMKNLCHKY NIPTAKYKTF SDASAAKEYI QEQGAPIVIK ADGLAAGKGV TVAMELEEAF EAVDSMLVKG VFGSAGCQVV VEEFLEGEEA SFFALVDGEN 301: AIPLESAQDH KRVGDGDTGP NTGGMGAYSP APVLTKELQD FVMESIIHPT VKGMAEEGCK FVGVLFAGLM IEKKSGLPKL IEFNVRFGDP ECQVLMMRLE 401: SDLAKVLLAA CKGELSGVSL DWSKDSAMVV VMASNGYPGS YEKGSIIKNL EEAERVAPGV KVFHAGTGLD SEGNVVATGG RVLGVTAKGK DLEEARERAY 501: SAVQQINWPG GFFRHDIGWR ALRQKQVATK EE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)