AT1G09430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP-citrate lyase A-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes subunit A of the heteromeric enzyme ATP citrate lyase (ACL). In animals, ACL is encoded by a single gene; ACL in Arabidopsis is composed of two polypeptides, ACLA (encoded by 3 genes) and ACLB (encoded by 2 genes). The holoenzyme has an A(4)B(4)stoichiometry. Expression of both ACLA and ACLB but not of either of the subunits alone results in ACL activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATP-citrate lyase A-3 (ACLA-3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATP-grasp fold, subdomain 2 (InterPro:IPR013816), ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type (InterPro:IPR013650), Succinyl-CoA synthetase-like (InterPro:IPR016102); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP-citrate lyase A-1 (TAIR:AT1G10670.4); Has 5303 Blast hits to 5302 proteins in 1635 species: Archae - 133; Bacteria - 3235; Metazoa - 230; Fungi - 139; Plants - 96; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1470 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3042135..3044978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46948.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 424 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARKKIREYD SKRLLKEHLK RLANIDLQIR SAQVTESTDF TELTNQESWL SSTKLVVKPD MLFGKRGKSG LVALKLDLAE VADFVKARLG TEVEMEGCKA 101: PITTFIVEPF VPHDQEYYLS IVSDRLGCTI SFSECGGIEI EENWDKVKTI FLPAEKSMTL EVCAPLIATL PLEVRAKIGN FIMGAFAVFQ DLDFSFMEMN 201: PFTLVDGEPF PLDMRGELDD TAAFKNFNKW GDIEFPLPFG RVLSSTENFI HGLDEKTSAS LKFTVLNPKG RIWTMVAGGG ASVIYADTVG DLGYASELGN 301: YAEYSGAPNE EEVLQYARVV IDCATTDPDG RKRALLIGGG IANFTDVAAT FNGIIRALRE KETRLKASRM HIYVRRGGPN YQTGLARMRA LGEELGVPLE 401: VYGPEATMTG ICKRAIDCIM LPDA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)