AT1G09000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NPK1-related protein kinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
NPK1-related protein kinase 1S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NPK1-related protein kinase 1 (NP1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Mitogen activated protein kinase kinase kinase 3 (InterPro:IPR015748), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NPK1-related protein kinase 2 (TAIR:AT1G54960.1); Has 134800 Blast hits to 132536 proteins in 4716 species: Archae - 154; Bacteria - 14967; Metazoa - 50642; Fungi - 13331; Plants - 33399; Viruses - 553; Other Eukaryotes - 21754 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:2891111..2894987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 73473.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 666 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQDFFGSVRR SLVFRPSSDD DNQENQPPFP GVLADKITSC IRKSKIFIKP SFSPPPPANT VDMAPPISWR KGQLIGRGAF GTVYMGMNLD SGELLAVKQV 101: LIAANFASKE KTQAHIQELE EEVKLLKNLS HPNIVRYLGT VREDDTLNIL LEFVPGGSIS SLLEKFGPFP ESVVRTYTRQ LLLGLEYLHN HAIMHRDIKG 201: ANILVDNKGC IKLADFGASK QVAELATMTG AKSMKGTPYW MAPEVILQTG HSFSADIWSV GCTVIEMVTG KAPWSQQYKE VAAIFFIGTT KSHPPIPDTL 301: SSDAKDFLLK CLQEVPNLRP TASELLKHPF VMGKHKESAS TDLGSVLNNL STPLPLQINN TKSTPDSTCD DVGDMCNFGS LNYSLVDPVK SIQNKNLWQQ 401: NDNGGDEDDM CLIDDENFLT FDGEMSSTLE KDCHLKKSCD DISDMSIALK SKFDESPGNG EKESTMSMEC DQPSYSEDDD ELTESKIKAF LDEKAADLKK 501: LQTPLYEEFY NSLITFSPSC MESNLSNSKR EDTARGFLKL PPKSRSPSRG PLGGSPSRAT DATSCSKSPG SGGSRELNIN NGGDEASQDG VSARVTDWRG 601: LVVDTKQELS QCVALSEIEK KWKEELDQEL ERKRQEIMRQ AGLGSSPRDR GMSRQREKSR FASPGK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)