AT1G08065.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha carbonic anhydrase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
alpha carbonic anhydrase 5 (ACA5); FUNCTIONS IN: carbonate dehydratase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: one-carbon metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: petal, leaf whorl, sepal, flower; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbonic anhydrase, alpha-class, catalytic domain (InterPro:IPR001148), Carbonic anhydrase, CAH1-like (InterPro:IPR018340); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha carbonic anhydrase 7 (TAIR:AT1G08080.1); Has 3351 Blast hits to 3338 proteins in 543 species: Archae - 0; Bacteria - 710; Metazoa - 2051; Fungi - 82; Plants - 328; Viruses - 7; Other Eukaryotes - 173 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2511788..2513341 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32165.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 277 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKIPSIGYVF FLIFISITIV SSSPDHGEVE DETQFNYEKK GEKGPENWGR LKPEWAMCGK GNMQSPIDLT DKRVLIDHNL GYLRSQYLPS NATIKNRGHD 101: IMMKFEGGNA GLGITINGTE YKLQQIHWHS PSEHTLNGKR FVLEEHMVHQ SKDGRNAVVA FFYKLGKPDY FLLTLERYLK RITDTHESQE FVEMVHPRTF 201: GFESKHYYRF IGSLTTPPCS ENVIWTISKE MRTVTLKQLI MLRVTVHDQS NSNARPLQRK NERPVALYIP TWHSKLY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)