AT1G07780.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphoribosylanthranilate isomerase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes phosphoribosylanthranilate isomerase which catalyzes the third step of the tryptophan biosynthetic pathway. Member of gene family. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phosphoribosylanthranilate isomerase 1 (PAI1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: N-(5'phosphoribosyl)anthranilate isomerase (PRAI) (InterPro:IPR001240), Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Ribulose-phosphate binding barrel (InterPro:IPR011060); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphoribosylanthranilate isomerase 2 (TAIR:AT5G05590.1); Has 5472 Blast hits to 5471 proteins in 2119 species: Archae - 168; Bacteria - 3853; Metazoa - 4; Fungi - 235; Plants - 77; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1135 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2410352..2411833 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29635.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 275 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSTGISTDLH VHFGALNFSK TYKSGLSNRT VSFSRVGYAQ NRKLSCSVSN TENVAPKDDE RGKDRPLVKM CGITSARDAA MAVEAGADFI GMIIWPHSKR 101: SISLSVAKDI SKVAREGGAK PVGVFVEDDE NTILRAADSS DLELVQLHGN GSRAAFSRLV RKRRVIYVLN ANQDGKLLNE VPEEDCHLAD WILVDSATGG 201: SGHGFNWAQF KLPSVRSRNG WLLAGGINPT NVSEALSILQ PDGIDVSSGI CGTDGIQKDK SKISSFITAV RSVHY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)