AT1G07660.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Histone superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Histone superfamily protein; FUNCTIONS IN: DNA binding; INVOLVED IN: nucleosome assembly; LOCATED IN: chloroplast, plasma membrane; EXPRESSED IN: cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histone-fold (InterPro:IPR009072), Histone core (InterPro:IPR007125), Histone H4 (InterPro:IPR001951); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Histone superfamily protein (TAIR:AT5G59690.1); Has 3260 Blast hits to 3260 proteins in 518 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1876; Fungi - 357; Plants - 492; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 531 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:2369212..2369523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 9394.63 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 86 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MSGRGKGGKG LGKGGPAIRR LARRGGVKRI SGLIYEETRG VLKIFLENVI RDAVTYTEHA RRKTVTAMDV VYALKRQGRT LYGFGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)