AT1G07600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.753 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : metallothionein 1A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
metallothionein, binds to and detoxifies excess copper and other metals, limiting oxidative damage. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
metallothionein 1A (MT1A); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: metallothionein 1C (TAIR:AT1G07610.1); Has 370 Blast hits to 296 proteins in 102 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 99; Fungi - 13; Plants - 182; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 74 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2338904..2339321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 4580.15 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 45 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MADSNCGCGS SCKCGDSCSC EKNYNKECDN CSCGSNCSCG SNCNC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)