AT1G07570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Protein kinase capable of phosphorylating tyrosine, serine, and threonine residues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
APK1A; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: protein kinase 1B (TAIR:AT2G28930.2); Has 112484 Blast hits to 111280 proteins in 3934 species: Archae - 89; Bacteria - 12638; Metazoa - 42028; Fungi - 9086; Plants - 32321; Viruses - 355; Other Eukaryotes - 15967 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2331369..2333210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45521.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 410 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGICLSAQVK AESSGASTKY DAKDIGSLGS KASSVSVRPS PRTEGEILQS PNLKSFSFAE LKSATRNFRP DSVLGEGGFG CVFKGWIDEK SLTASRPGTG 101: LVIAVKKLNQ DGWQGHQEWL AEVNYLGQFS HRHLVKLIGY CLEDEHRLLV YEFMPRGSLE NHLFRRGLYF QPLSWKLRLK VALGAAKGLA FLHSSETRVI 201: YRDFKTSNIL LDSEYNAKLS DFGLAKDGPI GDKSHVSTRV MGTHGYAAPE YLATGHLTTK SDVYSFGVVL LELLSGRRAV DKNRPSGERN LVEWAKPYLV 301: NKRKIFRVID NRLQDQYSME EACKVATLSL RCLTTEIKLR PNMSEVVSHL EHIQSLNAAI GGNMDKTDRR MRRRSDSVVS KKVNAGFARQ TAVGSTVVAY 401: PRPSASPLYV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)