AT1G06780.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.898 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galacturonosyltransferase 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with putative galacturonosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
galacturonosyltransferase 6 (GAUT6); FUNCTIONS IN: polygalacturonate 4-alpha-galacturonosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: carbohydrate biosynthetic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: los glycosyltransferase 5 (TAIR:AT2G30575.1); Has 1389 Blast hits to 1379 proteins in 238 species: Archae - 0; Bacteria - 400; Metazoa - 143; Fungi - 0; Plants - 830; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 16 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:2083689..2086853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67540.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 589 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKQIRRWQRI LILALLSISV FAPLIFVSNR LKSITPVGRR EFIEELSKIR FTTNDLRLSA IEHEDGEGLK GPRLILFKDG EFNSSAESDG GNTYKNREEQ 101: VIVSQKMTVS SDEKGQILPT VNQLANKTDF KPPLSKGEKN TRVQPDRATD VKTKEIRDKI IQAKAYLNFA PPGSNSQVVK ELRGRLKELE RSVGDATKDK 201: DLSKGALRRV KPMENVLYKA SRVFNNCPAI ATKLRAMNYN TEEQVQAQKN QAAYLMQLAA RTTPKGLHCL SMRLTSEYFS LDPEKRQMPN QQNYFDANFN 301: HYVVFSDNVL ASSVVVNSTI SSSKEPERIV FHVVTDSLNY PAISMWFLLN IQSKATIQIL NIDDMDVLPR DYDQLLMKQN SNDPRFISTL NHARFYLPDI 401: FPGLNKMVLL DHDVVVQRDL SRLWSIDMKG KVVGAVETCL EGESSFRSMS TFINFSDTWV AGKFSPRACT WAFGMNLIDL EEWRIRKLTS TYIKYFNLGT 501: KRPLWKAGSL PIGWLTFYRQ TLALDKRWHV MGLGRESGVK AVDIEQAAVI HYDGVMKPWL DIGKENYKRY WNIHVPYHHT YLQQCNLQA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)