AT1G06530.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Tropomyosin-related | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Tropomyosin-related; LOCATED IN: mitochondrion, plasma membrane, plastid; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Tropomyosin-related (TAIR:AT3G58840.2); Has 146608 Blast hits to 68961 proteins in 3334 species: Archae - 2609; Bacteria - 25073; Metazoa - 65463; Fungi - 13367; Plants - 8726; Viruses - 553; Other Eukaryotes - 30817 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:2001625..2002596 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36121.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 323 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEERSLNGE ATGQDDESFF DSDQQGDDGK STELNQKIGD LESQNQELAR DNDAINRKIE SLTAEIEELR GAESKAKRKM GEMEREIDKS DEERKVLEAI 101: ASRASELETE VARLQHELIT ARTEGEEATA EAEKLRSEIS QKGGGIEELE KEVAGLRTVK EENEKRMKEL ESKLGALEVK ELDEKNKKFR AEEEMREKID 201: NKEKEVHDLK EKIKSLESDV AKGKTELQKW ITEKMVVEDS LKDSEKKVVA LESEIVELQK QLDDAEKMIN GLKNVVEEPL NGIEFKSWSP NVTAVGSGGA 301: VAAVAVAVAG AAVVCYIYHS RRV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)