AT1G06130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glyoxalase 2-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
glyoxalase 2-4 (GLX2-4); FUNCTIONS IN: hydrolase activity, zinc ion binding, hydroxyacylglutathione hydrolase activity; INVOLVED IN: methylglyoxal catabolic process to D-lactate; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Beta-lactamase-like (InterPro:IPR001279), Hydroxyacylglutathione hydrolase (InterPro:IPR017782); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glyoxalase 2-5 (TAIR:AT2G31350.1); Has 15456 Blast hits to 15455 proteins in 2500 species: Archae - 395; Bacteria - 9969; Metazoa - 478; Fungi - 329; Plants - 213; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4072 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:1858034..1860640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36626.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 331 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQAISKVSSA ASFFRCSRKL VSQPCVRPCV RQLHVRKGLV SGVMKLFSSP LRTLRDAGKS VRISRFCSVS NVSSSLQIEL VPCLTDNYAY ILHDEDTGTV 101: GVVDPSEAVP VMDALQKNSR NLTYILNTHH HYDHTGGNLE LKDRYGAKVI GSAADRDRIP GIDVALKDAD KWMFAGHEVH IMETPGHTRG HISFYFPGAR 201: AIFTGDTLFS LSCGKLFEGT PEQMLASLQR IIALPDDTSV YCGHEYTLSN SKFALSIEPT NEVLQSYAAY VAELRDKKLP TIPTTMKMEK ACNPFLRTEN 301: TDIRRALGIP ETADEAEALG IIRRAKDNFK A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)