AT1G06030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pfkB-like carbohydrate kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
pfkB-like carbohydrate kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity, ribokinase activity; INVOLVED IN: D-ribose metabolic process, acetate fermentation, sucrose biosynthetic process, sucrose catabolic process, using beta-fructofuranosidase; EXPRESSED IN: guard cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbohydrate/purine kinase (InterPro:IPR011611), Ribokinase (InterPro:IPR002139), Carbohydrate/puine kinase, PfkB, conserved site (InterPro:IPR002173); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: pfkB-like carbohydrate kinase family protein (TAIR:AT1G06020.1); Has 18996 Blast hits to 18990 proteins in 2425 species: Archae - 390; Bacteria - 14287; Metazoa - 160; Fungi - 120; Plants - 469; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3570 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:1826880..1828130 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35894.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 329 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTSSNGDNKG LVVSFGEMLI DFVPTESGVS LSESSGFLKA PGGAPANVAI AVSRLGGRAA FVGKLGDDEF GHMLAGILRK NDVDDQGINF DKGARTALAF 101: VTLRSDGERE FMFYRNPSAD MLLRPDELNL ELIRSAKVFH YGSISLITEP CRSAHMKAME VAKEAGALLS YDPNLREPLW PSPEEARKQI MSIWDKADII 201: KVSDVELEFL TGNKTIDDET AMSLWHPNLK LLLVTLGENG CRYYTKDFHG SVETFHVDAV DTTGAGDSFV GALLNQIVDD QSVLEEEERL RKVLRFANAC 301: GAITTTKKGA IPALPTDCEA LSFLKIQVE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)