AT1G05220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.981 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Transmembrane protein 97, predicted | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Transmembrane protein 97, predicted; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Transmembrane protein 97, predicted (InterPro:IPR016964); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Transmembrane protein 97, predicted (TAIR:AT1G05210.1); Has 151 Blast hits to 151 proteins in 52 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 55; Fungi - 15; Plants - 75; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:1511943..1512656 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17837.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 160 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGALGKLINI SLFFFFALMA INVPLLNGQI LFPGIYPKLL TDLKDWYSSE FNDYLFIEKP LFFVGLVWHE IIFLLPLSIV NIYAILTSKS WFGTTSLLYG 101: ASFLTSMAAI LGDMIGSEKV TNKLLLAYLP FVGLAILAML RGLVTCSTKR STVLARRKLA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)