AT1G04750.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.973 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vesicle-associated membrane protein 721 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
vesicle-associated membrane protein 7B (At VAMP7B) mRNA, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
vesicle-associated membrane protein 721 (VAMP721); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: transport, vesicle-mediated transport; LOCATED IN: endosome, plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Longin (InterPro:IPR010908), Longin-like (InterPro:IPR011012), Synaptobrevin (InterPro:IPR001388); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: synaptobrevin-related protein 1 (TAIR:AT2G33120.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:1331857..1333426 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20508.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 181 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAQQSLIYSF VARGTVILVE FTDFKAYCVV AVDSAGRQIP MSFLERVKED FNKRYGGGKA ATAQANSLNK EFGSKLKEHM QYCMDHPDEI SKLAKVKAQV 101: SEVKGVMMEN IEKVLDRGEK IELLVDKTEN LRSQAQDFRT TGTQMRRKMW LQNMKIKLIV LAIIIALILI IVLSVCHGFK C |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)