AT1G04635.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.865 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ribonuclease P family protein / Rpp14 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
EMBRYO DEFECTIVE 1687 (EMB1687); FUNCTIONS IN: ribonuclease activity, ribonuclease P activity; INVOLVED IN: tRNA processing, embryo development ending in seed dormancy; LOCATED IN: vacuole; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribonuclease P-related (InterPro:IPR002759); Has 266 Blast hits to 266 proteins in 135 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 85; Fungi - 108; Plants - 56; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:1291350..1291805 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17017.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 151 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVGFKNRYML MEVFLDPDKD LLGEGTPIIL TQFNLSKAIK DSILVNFGEC GLGSSLGSFQ VKYVNPITKL CIVRSSREEH RQVWLAITLV KSIGNCPVIL 101: NLLDISGCIR ACRDTALKCD KEKFEQCSKS LSEEEIRQMN TSLEKIKLLE N |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)