AT1G03670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.569 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ankyrin repeat family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ankyrin repeat family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ankyrin repeat-containing domain (InterPro:IPR020683), Ankyrin repeat (InterPro:IPR002110); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ankyrin repeat family protein (TAIR:AT4G03500.1); Has 38664 Blast hits to 17395 proteins in 690 species: Archae - 39; Bacteria - 2692; Metazoa - 19825; Fungi - 3120; Plants - 3302; Viruses - 203; Other Eukaryotes - 9483 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:914222..916222 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67463.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 616 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKCDSKSETV SSSSTSGSLS DPDQWTIFKD KDESEIMNPA ILCAVRAGDK VSLLKRINDD VKVTQRLVDN QGNSILHIAA ALGHVHIVEF IISTFPNLLQ 101: NVNLMGETTL HVAARAGSLN IVEILVRFIT ESSSYDAFIA AKSKNGDTAL HAALKGKHVE VAFCLVSVKH DVSFDKNNDE ASPLYMAVEA GYHELVLKML 201: ESSSSPSILA SMFSGKSVIH AAMKANRRDI LGIVLRQDPG LIELRNEEGR TCLSYGASMG CYEGIRYILA EFDKAASSLC YVADDDGFTP IHMAAKEGHV 301: RIIKEFLKHC PDSRELLNNQ CQNIFHVAAI AGKSKVVKYL LKLDEGKRMM NEQDINGNTP LHLATKHRYP IVVNMLTWND GINLRALNNE GFTALDIAET 401: MKDNNAYVLY KRLIWMALVS AGAPHGPNLI PLTVSQSSKQ SPERYKDSVN TLMVTATLVA TVTFAAGLTL PGGYMSSAPH LGMAALVNKL NFKVFLLLNN 501: IAMCTSVVTV MALIWAQLGD ALLTKKAFRL ALPLLLTAVV SMMMASVAGL TLVVSDLPWL SHLVLAIDSA FLVFLMLLII PYAFSSTRHG FLRHIFYFPY 601: FLMLLVVSEG SNNMDG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)