AT1G02630.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.902 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleoside transporter family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Nucleoside transporter family protein; FUNCTIONS IN: nucleoside transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transport; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter (InterPro:IPR002259); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: equilibrative nucleotide transporter 1 (TAIR:AT1G70330.1); Has 1148 Blast hits to 1019 proteins in 199 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 540; Fungi - 114; Plants - 205; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 286 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:561007..562382 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43347.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 389 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVDEKVIVDE VETRDAYRVA YVIHFLLGAG SLIPWNALIT AVDYFGYLYP DKHVEKTFTV AYMSCSVLVL VLMMTWNTRM SYRVRMNLGF SMFIIAMMIS 101: PLIDWVWKGE KGENVSYMLM VGSVVLCGLA DGVVGGSLIG SAGKLPRQYM QAIFAGTASS GIIISLLRIA TKASLPQTPQ GMRTSAHSYF IVSSTILLCC 201: FISCNVLHKL PVMQQHLKFH QPLHSTLTIW MVGRKIKWPA SGMLIIYSVT LSIFPGFIAE NLKSQLLQSW YPILLITVYN ISDFVGKSLT ALYLWQSIKS 301: ATWACIVRLL FYPLFSACLR GPKWLRTEVP VVVLTFMLGL TNGYLTSVLM IMAPKTVHAS EAELAAIFMV VFLGLGLVCG SVIGWLWLI |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)