AT1G02620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.783 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ras-related small GTP-binding family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ras-related small GTP-binding family protein; FUNCTIONS IN: GTP binding; INVOLVED IN: intracellular protein transport; LOCATED IN: endomembrane system, intracellular; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Small GTPase SAR1-type (InterPro:IPR006687), ARF/SAR superfamily (InterPro:IPR006689); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: secretion-associated RAS super family 2 (TAIR:AT4G02080.1); Has 4733 Blast hits to 4733 proteins in 333 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2238; Fungi - 747; Plants - 975; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 773 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:557092..557668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 13826.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 122 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGPLTRVLIL VEWFSQVDAL VYLVDAYDQE RFAESKKELD ALLSDESLAT VPFLILGNKI DIPYAASEDE LRFHLGLSNF TTGKGKVNLT DSNVRPLEVF 101: MCSIVRKMGY GEGFKWLSQY IK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)