AT1G01590.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.898 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ferric reduction oxidase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a ferric-chelate reductase that is expressed at extremely low levels in Fe deficiency-induced seedlings. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ferric reduction oxidase 1 (FRO1); FUNCTIONS IN: ferric-chelate reductase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ferredoxin reductase-type FAD-binding domain (InterPro:IPR017927), Ferric reductase, NAD binding (InterPro:IPR013121), FAD-binding 8 (InterPro:IPR013112), Riboflavin synthase-like beta-barrel (InterPro:IPR017938), Ferric reductase-like transmembrane component, N-terminal (InterPro:IPR013130); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ferric reduction oxidase 3 (TAIR:AT1G23020.2); Has 2645 Blast hits to 2634 proteins in 373 species: Archae - 2; Bacteria - 275; Metazoa - 567; Fungi - 1143; Plants - 485; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 173 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:214229..217304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 79604.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 704 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGVGEMNKEV IDKVIKFLMM VILMGTIVIW IMMPTSTYKE IWLTSMRAKL GKSIYYGRPG VNLLVYMFPM ILLAFLGCIY LHLKKSTTVN QFNSGVEKKR 101: AKFGALRRPM LVNGPLGIVT VTEVMFLTMF MALLLWSLAN YMYRTFVNVT SESAATDGNN LWQARLDLIA VRIGIVGNIC LAFLFYPVAR GSSLLAAVGL 201: TSESSIKYHI WLGHLVMIIF TSHGLCYFIY WISKNQLVSK MLEWDRTAVS NLAGEIALVA GLMMWVTTYP KIRRRLFEVF FYSHYLYIVF MLFFVFHVGI 301: SHALIPLPGF YIFLVDRFLR FLQSRNNVKL VSARVLPCDT VELNFSKNPM LMYSPTSTMF VNIPSISKLQ WHPFTIISSS KLEPETLSVM IKSQGKWSTK 401: LYDMLSSSSS DQINRLAVSV EGPYGPSSTD FLRHESLVMV SGGSGITPFI SIVRDLFYMS STHKCKIPKM TLICAFKNSS DLSMLDLILP TSGLTTDMAS 501: FVDIQIKAFV TREEKTSVKE STHNRNIIKT RHFKPNVSDQ PISPILGPNS WLCLAAILSS SFMIFIVIIA IITRYHIHPI DQNSEKYTWA YKSLIYLVSI 601: SITVVTTSTA AMLWNKKKYY AKNDQYVDNL SPVIIESSPQ QLISQSTDIH YGERPNLNKL LVGLKGSSVG ILVCGPKKMR QKVAKICSFG SAENLHFESI 701: SFSW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)